MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187129	CT	3	6	35	40	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187129	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187129	TA	3	6	122	127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187129	TA	3	6	220	225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187129	T	6	6	241	246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187129	CAT	4	12	340	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248211
7	NT_187129	CAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248211
8	NT_187129	TCT	2	6	390	395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248211
9	NT_187129	TGT	2	6	437	442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248211
10	NT_187129	GCT	2	6	462	467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248211
11	NT_187129	CTT	3	9	526	534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248211
12	NT_187129	T	6	6	671	676	0 %	100 %	0 %	0 %	409248211
13	NT_187129	GCA	2	6	924	929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248211
14	NT_187129	CAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248211
15	NT_187129	A	6	6	1037	1042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187129	TAA	2	6	1064	1069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187129	TAT	2	6	1089	1094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187129	ATA	2	6	1098	1103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187129	TA	3	6	1102	1107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187129	G	7	7	1147	1153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187129	TGG	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187129	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187129	TCT	2	6	1205	1210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187129	T	7	7	1216	1222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187129	TAA	2	6	1228	1233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187129	CTT	2	6	1251	1256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187129	TGG	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187129	TCA	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187129	CGC	2	6	1421	1426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187129	GCG	2	6	1429	1434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187129	TAC	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187129	GC	3	6	1494	1499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187129	TGG	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187129	AT	3	6	1556	1561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187129	TTG	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187129	CCT	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187129	CG	3	6	1646	1651	0 %	0 %	50 %	50 %	409248212
38	NT_187129	TCC	2	6	1763	1768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248212
39	NT_187129	GCG	2	6	1774	1779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248212
40	NT_187129	CAG	2	6	2011	2016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248212
41	NT_187129	CCGC	2	8	2036	2043	0 %	0 %	25 %	75 %	409248212
42	NT_187129	GCC	2	6	2066	2071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248212
43	NT_187129	TCG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248212
44	NT_187129	CGT	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248212
45	NT_187129	GTT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248212
46	NT_187129	TG	3	6	2168	2173	0 %	50 %	50 %	0 %	409248212
47	NT_187129	TTCGCT	2	12	2350	2361	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409248212
48	NT_187129	CAGC	2	8	2439	2446	25 %	0 %	25 %	50 %	409248212
49	NT_187129	AT	3	6	2543	2548	50 %	50 %	0 %	0 %	409248212
50	NT_187129	TCA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248212
51	NT_187129	GGT	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248212
52	NT_187129	CAG	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248212
53	NT_187129	CAA	2	6	2766	2771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248212
54	NT_187129	GC	3	6	2799	2804	0 %	0 %	50 %	50 %	409248212
55	NT_187129	TGA	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248212
56	NT_187129	TCA	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248212
57	NT_187129	GGT	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248212
58	NT_187129	CTG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248212
59	NT_187129	GATG	2	8	2968	2975	25 %	25 %	50 %	0 %	409248212
60	NT_187129	GA	3	6	2979	2984	50 %	0 %	50 %	0 %	409248212
61	NT_187129	CGG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248212
62	NT_187129	GAT	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248212
63	NT_187129	GGCT	2	8	3184	3191	0 %	25 %	50 %	25 %	409248212
64	NT_187129	ATGCG	2	10	3230	3239	20 %	20 %	40 %	20 %	409248212
65	NT_187129	CAT	3	9	3265	3273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248212
66	NT_187129	GTT	2	6	3305	3310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248213
67	NT_187129	T	6	6	3377	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	409248213
68	NT_187129	AGCG	2	8	3389	3396	25 %	0 %	50 %	25 %	409248213
69	NT_187129	CGG	2	6	3439	3444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248213
70	NT_187129	GTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248213
71	NT_187129	GAA	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187129	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187129	AC	3	6	3576	3581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NT_187129	GAT	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187129	GTTGA	2	10	3686	3695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187129	CGT	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187129	GTT	2	6	3901	3906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187129	T	7	7	3919	3925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187129	CATA	2	8	3958	3965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NT_187129	A	6	6	4010	4015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187129	AAG	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248214
82	NT_187129	CA	3	6	4176	4181	50 %	0 %	0 %	50 %	409248214
83	NT_187129	ATG	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248214
84	NT_187129	CTG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248214
85	NT_187129	GAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248214
86	NT_187129	GAA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248214
87	NT_187129	ATA	2	6	4635	4640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187129	ACG	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187129	AAG	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187129	TGA	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187129	CAG	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187129	TAAA	2	8	4843	4850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187129	A	6	6	4869	4874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187129	A	6	6	4879	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187129	T	6	6	4957	4962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187129	GGA	2	6	4980	4985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187129	AAT	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248215
98	NT_187129	ATT	2	6	5076	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248215
99	NT_187129	CTC	2	6	5099	5104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248215
100	NT_187129	TATGA	2	10	5109	5118	40 %	40 %	20 %	0 %	409248215
101	NT_187129	ATA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248215
102	NT_187129	GAA	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248215
103	NT_187129	TTA	2	6	5250	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248215
104	NT_187129	GAT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248215
105	NT_187129	AAAG	2	8	5269	5276	75 %	0 %	25 %	0 %	409248215
106	NT_187129	GCTT	2	8	5294	5301	0 %	50 %	25 %	25 %	409248215
107	NT_187129	TA	3	6	5307	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	409248215
108	NT_187129	TACC	2	8	5315	5322	25 %	25 %	0 %	50 %	409248215
109	NT_187129	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248215
110	NT_187129	TTA	2	6	5471	5476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248215
111	NT_187129	TTC	2	6	5596	5601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248215
112	NT_187129	GA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	409248215
113	NT_187129	CTG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248215

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.